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计算机系统结构二级学科研究并行分布计算、新型计算机、计算机网络与通信、嵌入式系统、集成电路设计、信息存储、可信计算与容错计算等方向。
2、计算机软件与理论
计算机软件与理论主要包括软件设计、开发、维护和使用过程中涉及的理论、方法和技术，探讨计算机科学与技术发展的理论基础。计算机软件与理论的研究范围十分广泛，包括系统软件、软件自动化、程序设计语言、数据库系统、软件工程与软件复用技术、并行处理与高性能计算、智能软件、理论计算机科学、人工智能、计算机科学基础理论等。本专业学生应具备扎实的近代数学基础，掌握软件开发和维护的理论和方法，以及计算机系统结构和计算机应用的基本知识。1.研究方向软件工程，系统软件，软件自动化，新型程序设计语言，分布式系统，数据库系统，并行计算，智能软件，软件理论。
主要课程近代数学，新型软件技术，高等数理逻辑，代数算法，组合数学，软件开发环境，面向对象技术，新型程序设计语言，软件方法，分布式系统和计算机网络，高级操作系统，数据库新技术，人工智能，并行处理，形式语言和自动机，高级计算机系统结构，算法设计和分析，人机界面，图形图像处理。胜任高等学校教学、科研及软件研究和设计工作。
3、计算机应用
1)科学计算与智能图像处理主要研究： 医学图像处理与压缩技术;医学图像配准与融合技术;DICOM3.0医学图像传输标准的研究。
2)计算机网络技术及应用 主要研究新型网络通信协议，网络互连与路由选择，网络规划与设计，网络性能分析，网络管理，网络与信息安全技术，网络信息检索与服务系统，目录服务，远程教育及其他网络应用系统。
3)专家系统和人工智能 主要研究将人工智能技术、专家系统的理论和开发技术、智能监控技术等。对现实世界的大型复杂问题领域，使用人工智能的方法进行合作问题求解。涉及自动推理技术、过程规划和调度、并行处理和协同规划、分布式知识库的管理。
4)信息检索以语言文本与多媒体资料为基础，特别是国际互联网信息为背景，进行图文、声音、图形、图像等信息摘取、过滤、分析、识别、组织、检索、分类和知识挖掘等。 5)数据挖掘主要研究数据挖掘模型建模技术、数据预处理技术、挖掘算法的选择与设计、以及挖掘结果的评价技术。
6)分布式计算模型 主要研究网格环境下的资源管理。
7)工作流系统技术主要研究工作流模型、工作流运行体系结构、工作流并发控制机制等。 8)数据库系统及其应用 主要研究数据库系统实现技术，多媒体数据库，面向对象数据库，Internet相关数据库技术，数据库安全，分布式数据库。
9)数据流管理 研究实时数据流任务的可调度性、实时数据流查询处理的自适应性和面向专门应用的数据流可操作性。
10)信息安全 主要研究数据共享、数据发布和数据挖掘的数据隐私保护算法。
